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«РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК ИНСТИТУТ ПРОБЛЕМ ПЕРЕДАЧИ ИНФОРМАЦИИ ИМ. А.А. ХАРКЕВИЧА на правах рукописи ...»

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Приложение 12.

Множественное выравнивание для белков NarL и NarP. Участки,соответствующие последовательности HTH, показаны белым шрифтом на темном фоне. Условные обозначения: “*” – абсолютно консервативная позиция;

“:” – позиция с высокой степенью консервативности;

“.” – позиция с низкой степенью консервативности. Обозначения геномов: см. “Условные обозначения и сокращения”.

NarP(YPK) MLFELQGELFIMTKSHTILIVDDHPLMRRGIKQLLGLDSRFDVVAEANNGSDAITEAAKFQPDVILLDLNMKGMSGL NarP(YEN) -----------MTKSHTIMIVDDHPLMRRGIKQLLELDSNFDVVAEANCGSDAIIEAAKCQPDVILLDLNMKGMSGL NarP(ECO) ---------MPEATPFQVMIVDDHPLMRRGVRQLLELDPGSEVVAEAGDGASAIDLANRLDIDVILLDLNMKGMSGL NarP(STY) ---------MPEVTPFQVLIVDDHPLMRRGIRQLLELDPAFYVVAEAGDGASAIDLANRIEPDLILLDLNMKGLSGL NarP(PCA) ---------MSEKPSYRVLIVDDHPLMRRGIRQLLATDAIFDVIGEASNGVEALSLANRDSPDIILLDLNMKGLSGL NarP(PMU) -----------MSEKMKVLIIDDHPLMRRGIKQLMELAPNFEVVADAGNGSEGISLALQTQPDLIILDLNMKGLSGL NarP(AAC) -----------MTDKLKVLIIDDHPLMRRGIKQLVELEEGFEVVGGAGNGTEGINLALQTSPDLIILDLNMKGLSGL NarP(HIN) -----------MQDKLKVLLIDDHPLMRRGIKQLVELDDNFEVVADVSSGTEGISVALQTSPDVIILDLNMKGLSGL NarP(HDU) -----------MTESYKILLIDDHPLMRQGIRQILELEDNFTIVGEASNGNDGIALALDTDPDLIILDLNMKGISGL NarP(VPA) --------------MCKVMLVDDHPLMRRGIHQLLSFEPEFEVVAEASNGADAVAKAHELELDLVLLDLNMKGMSGV NarP(VVU) ------------------MLVDDHPLMRRGINQLLSFEEQFEVVAEASNGTEAVAKAHENELDLILLDLNMKGMSGL NarP(VCH) ------------------MLVDDHPLMRRGINQLLSFEEEFEVVAEAGSGAEAIALAHDLQPDLILLDLNMKGMSGL NarP(VFI) --------------MWNVVIVDDHPLMRRGIGQLLSFDEEFTLTGEASNGTDAVALISQDEPDLVLLDLNMKGMSGL NarL(ECO) ---------MSNQEPATILLIDDHPMLRTGVKQLISMAPDITVVGEASNGEQGIELAESLDPDLILLDLNMPGMNGL NarL(STY) ---------MNNQEPATILLIDDHPMLRTGVKQLVSMAPDISVVGEASNGEQGIDLAESLDPDLILLDLNMPGMNGL NarL(PCA) ---------MINEDAATLLLIDDHPMLRNGVKQLISMDPELQVAGEASHGEQGVELAEQLDPDLILLDLNMPGMNGL :::****::* *: *:: :... *..:. *:::***** *:.*:

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Приложение 13.

Множественное выравнивание для белков NarX и NarQ. Условные обозначения: “*” – абсолютно консервативная позиция;

“:” – позиция с высокой степенью консервативности;

“.” – позиция с низкой степенью консервативности. Обозначения геномов: см. “Условные обозначения и сокращения”.

NarQ(ECO) -----------MIVKRPVSASLARAFFYIVLLSILSTGIALLTLASSLRDAEAINIAGSLRMQSYRLGYDLQSGSPQ NarQ(STY) -----------MTVKRPVSASLAKAFFYIVLLSILSTGSALLTLTSSLRDAEAINIAGSLRMQSYRLGYDLQSRSPQ NarQ(PCA) -----------MMVKRPVSTSLARAFFYIALLSFLTTGIALLTLASGLRDAEAINVAGSMRMQSYRMGYDLQGDRAA NarQ(VPA) ---------MFKNVKKSVTRTIASAMLLILLLSVATTGFAIFTLASSLNDAEAVNVAGSMRMQSYRLAHDIQIRSVD NarQ(VVU) -------------------------MGLILLLSIATTSFAIINLASSLNDAEAVNVAGSMRMQSYRLAHDIQINAQD NarQ(VCH) MVINQRETALFTPVRHSLTRTMAKAMLLILFLSALTTGVAIVTLASSLNDAEAVNVSGSMRMQSYRLAYDIQTQSHD NarQ(VFI) ---------MKHNKTSILTRTIAQVMLLIVMISIITTSLALITLSSSLKDAEAVNIAGSLRMQSYRLAYDIETNSPE NarQ(AAC) -MTRFLPRLVILKIKHSVSTRIANYLIVIIIFVGIIGALSLALMAGNKSYAEAINVSGSLRMQSYRILYEIEHEPQM NarQ(PMU) -----------MKIKHSVSTKIANYLFIIMIFAGVITSLSLMIMASNKSDAESINVSGSLRMQSYRLLHELEHHPEL NarQ(HIN) -----------MYTKGSVSTRIAKYLFIILIVAGVISSLSLAIMSSNKYDAEAINISGSLRMQSYRLLYEMQEQPES NarQ(HDU) -----------MYTKYSIARRIGFYFLIMIGFASLISGISLGIMWSNKSDAGLINVSGSLRMQSYRFLYEMEHHPNS NarX(ECO) -------MLKRCLSPLTLVNQVALIVLLSTAIGLAGMAVSGWLVQGVQGSAHAINKAGSLRMQSYRLLAAVPLSEKD NarX(STY) -------MFKRCFSPLTLVNQLALIVMLSTAIGVAGMAVSGWLVQGVQGSAHAINKAGSLRMQSYRLLAAVPLDAKD NarX(YPK) MVKGISHAMKRYLTP--LVNQIALLMILLGMLGLAGMVISSWMAQSIQGNAHAINQAGSLRMQSYRLLSMIPLDSNE NarX(YEN) --------MKRYLIP--LVNQIALLMILLGMLGLAGMTISSWMAQSIQGNAHAINKAGSLRMQSYRLLSMVPLDKGD NarX(PCA) -------MLKRFLLPLSLVNQVALLMLLLGLLGIAGMSVSSWMSQSIQGNAHAINKAGSLRMQSYRLLSMVPLSAEN.. :. * :* :**:******: :

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NarQ(ECO) QHYAERKMLLVVAISLAGGIGIFTLVFFTLRRIRHQVVAPLNQLVTASQRIEHGQFDSPPLDTNLPNELGLLAKTFN NarQ(STY) QHYAERKVMLVVAISLAGGIGIFTLVFFTLRRIRQQVVRPLNQLVTASQRIEHGQFAPLPLDTSLPNELGLLAKTFS NarQ(PCA) QHYSERKMMIVVVTSIIGSITIYILIFFTLRRIRRQVVVPLNKLMAACASIEKGRFTHSRLDVNLPNELGLLAQTFS NarQ(VPA) QNFSEQKLINLAWIGGLGLGGILCASMFVVHFIRLEVVRPLRALVFASERIKNRSFD-INLAVSSDNEMGILTRTFN NarQ(VVU) QHFSEQKLIKLAWVGGLGLGGILLVSIFVVHFVRVTPLKAMVTASEQIQSRSFD-VSLNVTSDNEMGILTRTFN NarQ(VCH) QRFSERKLIALAAVGSFGLGGIFAVSLFVVYYIREQVVRPLNAMVDASEKIKNRNFD-VMLEETSSTEMGILSRTFN NarQ(VFI) QEFSERKLQLLSLIGALGLSLIVFSSIFIIFFTQRKIVSPLHHLVAASHAMTKGNYS-VQVDLNSDNELGQLGNAFN NarQ(AAC) QHSAEEKWIWALCVIIFSMLLIVIMVSYVNWYTRKAVVRPLEQLTRASTQVQMGQFKHIPLDVRKEDELGHLARTFT NarQ(PMU) QRFAEKKWIIAVLIMSLSMLSIIAMVAYVVWYARKEVVMPLKQLTQASIQVQMRQFSHVKVDTQKEDELGNLARAFS NarQ(HIN) QRFSEQKWILGVSVLGFAMLLILLMVSYVIWYTNVKPLHLMTKASMQVQMRQFNHIPLDTRKQNELGTLARVFT NarQ(HDU) QSFAELKLKIAIGVIIVSMLLIIGLAYIGVWYTRKKIIAPLNQLVVASRQIKNEDFDHVRLVVTEPNELGFLSSTFT NarX(ECO) DRTTEMRIETVVLVHRVMAVFMALLLVFTIIWLRARLLQPWRQLLAMASAVSHRDFTQRANISG-RNEMAMLGTALN NarX(STY) DHTTELRIERVVLVHRVMAIFMALLLVFTIIWLRVRLLQPWKQLLSMARAVSQRDFTQRANISG-RNEMAALGSALN NarX(YPK) DHKTEQRLLQVTLIPLVFSLLTLSLLLAMIYYLRRRLLRPWLKLISMANAIGRGDFSQRYTLDYQRDEMGMLGTALN NarX(YEN) DHKTEQRLLLVTMIQLVFIVLTLGLMLATIYYLRRRLLRPWLQLISMANAIGRGDFSKRFSLPYQRDEMGMLGTALN NarX(PCA) DHKTEQRLMMVTLVQRIFIGIMFILLIATFFYLRRRLLTPWRRLVSMAQAIGQGDFTQRVAITG-HDEMSKLGQALN : :* :. :: * :.: : *:. *.:.

NarQ(ECO) QMSSELHKLYRSLEASVEEKTRDLHEAKRRLEVLYQCSQALNTSQIDVHCFRHILQIVRDNEAAEYLELNVGEN-- NarQ(STY) QMSSELHKLYRSLEASVEEKTHDLHEAHRRLEVLYQCSQALNTSQIDVHCFRHILQIVREHDAAWYLELTVGDN-- NarQ(PCA) SMTDELQKLYRSLEDKVRQKTLRLQEVNRMLKVLYNCSQAMNVSTIDRHCFQQILQIVHRYETVVCLEMRVGEN-- NarQ(VPA) RMATDLGKLYRGLEQAVDEKTRKLQHANQSLEVLYDSSKELTASRINQDNFQAILKHIASLEGIKAVKLEIEQLGEP NarQ(VVU) NMAADLGKLYRGLEQAVNEKTHKLQHANQSLQVLYHSSQELTASRISQENFQAILRHIVSIEGIVSAKLEIEEIGER NarQ(VCH) SMAGDLGKLYRGLEHAVNEKTNKLQMANQSLQVLYHSSQELTASRITASNFQTILRHWVALEGICALRLEIEEEAGK NarQ(VFI) HMTRQVDLSYRELESRVEDKTKKLSQANRSLMILYQCSQQLSASQLDEQAFKNILDTFTNIEGIISARLIVEEESGG NarQ(AAC) KMSSELGKLYSGLEATVNEKTQKLQQTNRSLTTLYHCSQLVTTNKIDGKILQLVLQNVMISEHLRYLELDVLDAPHW NarQ(PMU) QMSSELEKLYSSLEESVNEKTQKLRQTNRSLTMLYESSQQLTTTNVDESILQHVLKNIFISEHLRYMALVVEGAEHW NarQ(HIN) QMSTELGQLYSRLEEAVNEKTQKLRQTNRTLSTLYQSAQLLNTNTINDKILNQVLNYIFISDHLNFVKVEVMGAEHW NarQ(HDU) QMASELAKLYASLEEKVEDKTRRLISVNHSLLVLFQCSQLLSAKPLNQSVLYEVLQIILDNEHLRAIEIQVYGADYW NarX(ECO) NMSAELAESYAVLEQRVQEKTAGLEHKNQILSFLWQANRRLHSRAPLCERLSPVLNGLQNLTLLRDIELRVYDTD-D NarX(STY) NMSEELAESYAVLEQRVQEKTAGLEHKNQILSFLWQANRRLHSQAPLCERLSPVLNGLQNLTQLHDIELRVYDLE-D NarX(YPK) RMSQELSLIYGDLEQRVVNKTADLQQKNQVLAFLYHSSRQLHTHQPLSERLAPVIEQLQALTTLENVQICLYENHLY NarX(YEN) RMSQELSVIYSDLEQRVAQKTADLQQKNQVLAFLYHSSRQLHTTQPLSERLVPVIEQLQTLTPLENVQICLYENHLY NarX(PCA) SMSDELSAMYHSLEQRVAEKTADLQQKNDLLSFLYRASRRLHTGAPLCSRLMPILNELPSLTPLRNIQLRLYEDN-N *: :: * ** * :** * : * *:. : : : :: ::

NarQ(ECO) -WRISEGQPNPE----------------------------LPMQILPVTMQETVYGELHWQNSHVSSSEPLLNSVSS NarQ(STY) -WRISEGTQSPD----------------------------LPMQMLPVTMQDTVYGELHWQSPNVNASTPLLNSVST NarQ(PCA) -WLLCEGQPDEQ----------------------------TAWQTLPIRLQEVEFGQLRWQASTQQPSAQLMESVAN NarQ(VPA) NWILTEGEECCHDCD-------------------------DECHAEPLTLDGEHLGSLYWKAGLPCPNETLIDNFVQ NarQ(VVU) NLVLTEGPKCVG-----------------------------RCNQKALTLDGQHLGYLHWCSGLPCPDQALIDNFVQ NarQ(VCH) PLILQEGKPSGA-----------------------------VMLQTPLTLDGHHLGFLYWEAGSPEPDRALIDNFAL NarQ(VFI) DWEITSGEPDES-----------------------------PWSLQELCIDGEQLGYLLWQESLPCPDQKLIINISN NarQ(AAC) NICLGVKYDQLE------------------------------SQQTEMNIEGESLAVLRWQAGLPCPDLRTMQNVAQ NarQ(PMU) NIRFGQKQANQD------------------------------CQEVTLQIEDEKLAVLYWQAGFPCPDPRTMRNIAQ NarQ(HIN) DITLGKQDANNE------------------------------LQIETLSVDNEELGVLSWQAGLPCPDPRIMQNLAQ NarQ(HDU) NVTIDNAPAQT-------------------------------WDFTEIAVENEKVARLGWKPSLLCPDER-IKNVSE NarX(ECO) EENHQEFTCQPDMTCDDKGCQLCPRGVLPVGD---RGTTLKWRLADSHTQYGILLATLPQGRHLSHDQQQLVDTLVE NarX(STY) EDNHQEFTCQSDISCDDKGCHLCPRSALPMIN---GGTTLKWRLTDSHTQYGILLATLPYGRHLSHDQQQLVDTLVE NarX(YPK) RDHVNHNADAEYLMPKNRPASLTISGPVRPISHPELWQSLSWSLSDKLGQYGLLLAKQPLDNPLNSDQQQLVDMLVE NarX(YEN) RSHLADHLDGEYLPPQNRPTQLTISGSFIVTNPPTARESLSWRLSDKLGQYGLLLAKLPSETPLNSDQQQLVNMLVE NarX(PCA) QEQFHQFSDCSQSQPEHCPDNSCQSCGMQVKRDDLQGEPHCWDLHDKHGQYGVVLATLPGNTALSRDQNQLLNTLLE.. :.

NarQ(ECO) MLGRGLYFNQAQKHFQQLLLMEERATIARELHDSLAQVLSYLRIQLTLLKRSIPEDN-----ATAQSIMADFSQALN NarQ(STY) MLGRGLYFNQAQKHFQQLLLMEERATIARELHDSLAQVLSYLRIQLTLLKRAIPEDN-----AGAQSIMADFSRALN NarQ(PCA) MLGRGLYFNQAQKHYQQLLLMEERATIARELHDSLAQVLSYLNIQMTLLKRAVAEEN-----AQARQIITDFEQALS NarQ(VPA) ILSRAVYYNRAQRQAEQILLMEERATIARELHDSLAQALSYLKIQVALLKRSVKNLPDEKAIAQANQVIAELDTGLS NarQ(VVU) ILSRAVYYNQAQRQAEQLLLMEERATIARELHDSLAQSLSYLKIQVSLLKRSVAKLNDEPQLARTNQVIAELDTGLS NarQ(VCH) ILSRAIYYNQAQRQAEQLLLMEERATIARELHDSLAQSLSYLKIQLTLLKRSVTPLKSDGDLSKTENIIREIDKGLS NarQ(VFI) ILARGIFYNQAQKQTHQLILLEERSTIARELHDSLAQSLSYLKIQTTLLKRQLEKC----DCINTSTTLVELDEGLK NarQ(AAC) MLSRSLYFQRMQRQQEQLLLMEERSIIARELHDSLAQVLAFLQIQLTLLKHNLNKGETD-SKQKSLSIIKQFEQALS NarQ(PMU) ILSRTLYFHKTQRQQQQLLLMEERAIIARELHDSLAQVLAFLQIQLTLLKHNINQKSEE-AAQQSINIIASFEQALR NarQ(HIN) MLARALYFHKNLRQKEQLLLMEERSIIARELHDSLAQVLSFLQIQLTLLKHNLKKEDEQ-SKEKSLAIIANFEQALS NarQ(HDU) MIGRSLYVLQVQKQQQQLVLMEERSIIARELHDSLAQSLTFFKIQISLLKYNSETVKNW-HKQK--TILADFEKALN NarX(ECO) QLTATLALDRHQERQQQLIVMEERATIARELHDSIAQSLSCMKMQVSCLQMQGDALPES-----SRELLSQIRNELN NarX(STY) QLTATLALDRHQERQQRLIVMEERATIARELHDSIAQSLSCMKMQVSCLQMQGDALPES-----SRELLSQIRNELN NarX(YPK) QLTSTLALESQAKHQQQLLLMEERSAIARELHDSIAQSLSCLKIQISCLQMQTPDLPEN-----SNLLIKQMRDELN NarX(YEN) QLTSTLALESQARHQQQLLLMEERSAIARELHDSIAQSLSCLKIQISCLQMQVPDLPDP-----SKLLIQQMRDELN NarX(PCA) QLTSTLALERQSNHQQQLMLMEERATIARELHDSIAQSLSCLKIQVSCLQMQGGDLPPA-----SQQLLMEMREELN : :.:.:::::***: ********:** *: :.:* : *: :.: * NarQ(ECO) DAYRQLRELLTTFRLTLQQADLPSALREMLDTLQNQTSAKLTLDCRLPTLALDAQMQVHLLQIIREAVLNAMKHANA NarQ(STY) DAYRQLRELLTTFRLTLQQADLPSALHEMLEDLQSQTPAKLKLDCRLPTLALDAQMQVHLLQIVREAVLNAIKHANA NarQ(PCA) DAYRQLRELLGTFRLTLQQADLPAAMQEMIEPLRVQTPATIDIDCRIPTQALDASQQVHLLQIIREAVLNAIKHAQA NarQ(VPA) AAYTQLRELLTTFRLTIKEGSFGQALQEMVETLNEQTTAEITLKNRLSSTELDAHQQVHLLQLIREAALNAIKHAQA NarQ(VVU) SAYTQLRELLTTFRLTIKEGTFGQALQEMVVQLGDQTEAEIHLTNDLSSVELDAHQQVHLLQLIREATINAIKHSKA NarQ(VCH) DAYTQLRELLTTFRLTLTEGSFGQSLLGMLTQLSGQTDAKIELNNALSSIALDAHQQVHLVQLIREATINAIKHAKA NarQ(VFI) SAYSQLRGLLNTFRLTINKAHFGEALQEIMTTLASQTKINIHLNNELPSLPINAQQHVHLLQLIREATLNAIKHSKA NarQ(AAC) DGYSQLRELLATFRLTVQEANLKLALEQVIDSLRNQTDIQMSVDCTLPSQSFNAQQLVNALQIVREAVLNAIKHSQG NarQ(PMU) DGYVQLRELLATFRLTVQEANLKLALEQVVDSLRNQTDIQMCVQCSLPAQSFNAKQLVHILQIVRESVLNAIKHSKG NarQ(HIN) GGYAQLRELLATFRLTIQEANLQLALKQVIDSLRSQTTMQMNVNCQLPSQSLNPQQLVHVLQIVREATTNAIKHSQG NarQ(HDU) EAYSQLRELLSTFRLTIEEANLTCALERVLDSLRSRTSAKISLNCKLPSQTFSAQQQVHALQIVREAVINAIKHSNA NarX(ECO) ASWAQLRELLTTFRLQLTEPGLRPALEASCEEYSAKFGFPVKLDYQLPPRLVPSHQAIHLLQIAREALSNALKHSQA NarX(STY) CSWAQLRELLTTFRLQLTEPGLRPALEASCQEFSARFGFTVKLDYQLPPRLVPSHQAIHLLQIAREAPSNALKHSHA NarX(YPK) IAYRQLRELLTTFRLKLNEATLEAALQALVNEFSERAGLSITFKYQLPPDQVPNHQAIHMVNIVREALNNIYKHARA NarX(YEN) IAYRQLRELLTTFRLKLNEATLQAALQNLVNEFSERANLPITLDFNLPSDSIPNHQAIHMVNIAREALNNIYKHAHA NarX(PCA) TAYRQLRELLTTFRLKLSESGLLAALRASIDEFGKRLGYPIELHYRLPPQSVSAHQGIHVLQIVREALSNIYKHAQA.: *** ** **** : : : :: : :. :... :: ::: **: * **:..

NarQ(ECO) SEIAVSCVTAPDGNHTVYIRDNGIGIGEPKEPEGHYGLNIMRERAERLGGTLTFSQPSGGGTLVSISFRS-AEGE NarQ(STY) SEIAVSCVTAPDGDHTVYIRDNGIGIGEPHEPAGHYGLNIMRERAERLGGTLNFSQPSGGGTLVSISFRS-SNKE NarQ(PCA) TTITVNCCTQPDGSHCV®DDGCGIINQEEPAGHYGLNIMQERAERLGGRLAIGLHPEGGTQVSVRFSTPTTAR NarQ(VPA) DHIHIQCLDC-DGKVTVTVSDDGVGFEHQDEKINHYGMTIMQERAARLHADLQIEASINKGCTVKLEFQHSKEVN NarQ(VVU) ANIRIECCEE-GEWVTVSVSDDGVGFDQCNQKLNHYGMSIMQERAARLNGSLSVTASPQNGCAVVLKYQRIKETR NarQ(VCH) TKIKVNCQEQ-QGRVQVTIEDDGVGFDLQDHKINHYGMSIMQERAARLRGELKVESAPGKGCKVVLTYQQSEEKN NarQ(VFI) DNIIITCFQE-GEQGCINIEDDGVGFDPTEEKINHYGLRIMQERANCVHGKLSITSEIDNGCTVNVMFPLNQ-- NarQ(AAC) TLIEVIAHTNEDGEYELVVRDNGIGIPSLEEPDGHYGLNIMHERSIQLNAKLTIANRTDGGTEVKVTLAHTL-- NarQ(PMU) NRIEVIAHINEDGEYEFIVRDDGIGIPSLEEPEGHYGLNIMHERATQLNAHLRIANRPSGGTEIKLTLHQNRNLT NarQ(HIN) TVIEISARINAEGEYEILVEDDGVGIPNLEEPEGHYGLNIMAERCRQLNAQLHIHRREQGGTQVKITLPHTLY- NarQ(HDU) TQIEVIAETNQDGEQCLIVRDNGNGIVNGIEPDDHYGLTIMKERAAQLKGEFTIINRAEGGVQVMVTLPNTL-- NarX(ECO) SEVVVTVAQN-DNQVKLTVQDNGCGVPENAIRSNHYGMIIMRDRAQSLRGDCRVRRRESGGTEVVVTFIPEKTFT NarX(STY) DDVVVTVTQC-GKQVKLKVQDNGCGVPENAERSNHYGMIIMRDRAQSLRGDCQVRRRETGGTEVTVTFIPETNFT NarX(YPK) SEATVNVHLE-QGDVVMSITDNGCGIGQASEQPNHYGLMIMQDRANSLHGHCSINQKEGGGTEVRVQFTPEN-- NarX(YEN) TEAAVKVTAE-QGDVVMSILDNGCGIGQASKRPNHYGLMIMQDRATSLHGHC®QREEGGTEVRVRFTPDN-- NarX(PCA) TQVDITLQLR-QGYIELSVTDNGIGIPDDASRANHYGLIIMRDRARGLHGECIVRRRPSGGTEVNVSFLSEYRHR :. : *:* *..***: ** :*. :.. *::

NarQ(ECO) ESQLM----- NarQ(STY) ESQLT----- NarQ(PCA) ERDNTNNLYPE NarQ(VPA) FDSV------ NarQ(VVU) I--------- NarQ(VCH) KNEL------ NarQ(VFI) ---------- NarQ(AAC) ---------- NarQ(PMU) ---------- NarQ(HIN) ---------- NarQ(HDU) ---------- NarX(ECO) DVQG-DTHE- NarX(STY) ETQG-DTHE- NarX(YPK) -----NDLD- NarX(YEN) -----DDLD- NarX(PCA) LPLTGETHD- Приложение 14.

Последовательности потенциальных сайтов связывания белка Fnr. Указано положение сайта относительно старта трансляции гена. Позиции сайта, совпадающие с консенсусом, показаны прописными буквами, несовпадающие – строчными.

Сайт Геном Оперон Положение Вес Последовательность TTttTgTtAATCAA -400 4, Y. pestis adhE TTGATaTAtgTCAA -299 4, arcA TgGATTTttAaCAA -303 3, ccmABCDEFGH TTGtTcTAAATCAA -313 4, cydAB TTGtcgTAgATCAA -262 4, TTGATTccAgaCAA -200 3, dmsABC aTGATaaAgATCAA -144 4, fadBA TTGtTTaAAAaCAA -51 4, fadD TTttTTgAgATCAA -166 4, fadL TTGAcgcAtATCAA -33 4, fnr aTGATccAtATCAA -81 3, focA TgGATcTtgATCAA -482 4, fumC aTGcTaTtAATCAA -26 3, glgBXCAP TTGATcacAATCAt -146 4, glpABC TTGtTTcttATCAA -92 4, TTctTaTcAATCAA -88 3, aTGATgTAAATCgA -215 4, glpD TTGATTacAATCgt 20 3, gTGATTTtAAaCAA -309 3, moaACDE gTGATcTtAATCAA -218 4, mtlADR TTGATcTtgcgCAA -212 3, napFDABC TTGATTTcAATaAt -120 3, TTGATaTAtATCAA -149 4, ndh TTGATTTAcATCAA -70 5, nirBDC-cysG aTGATTaAAATaAA 17 3, nqrABCDEF TTGtTcTAggTCAA -191 4, nrdDG aTGATTTcggTCAA -64 4, pdhR-aceEF-lpdA TTGATcatgATCAc -24 3, pepT TcGATgTccAaCAA -4 4, ppsA TTGAcTgAcgTCAg -419 3, talB TTttTTTtAATCAA -125 4, TTGATaTAAAaCAt -112 4, yfiD TTGATTTgAATCAA -59 4, TTGATTTtAAaCAA -471 4, Y. enterocolitica arcA TTGATaTAtgTCAA -297 4, TTGAagatgATCAA -499 4, atpIBEFHAGDC TTtATTaAcAgCAA -377 3, cydAB TTGtTcTAAATCAA -313 4, TTGtTcTggATCAA -262 4, TTcATTTggATCAA -25 3, dcuA Сайт Геном Оперон Положение Вес Последовательность TTtATTTAAAaCAA -286 4, Y. enterocolitica dcuB TTGATagAtgTCAt -172 3, dcuC aTGATaaAAATCAA -144 4, fadBA TTttTTgcAATCAA -162 3, fadL TTGATTcAAATCAt -318 4, feoAB TTGAcgcAtATCAA -33 4, fnr aTGATccAcATCAA -78 4, focA TTGAggTAgtTCAA -271 3, frdABCD TTGAccTtgATCAt -113 4, glgBXCAP TTGATcacAATCAt -146 4, glpABC TTGtTccttATCAA -92 4, TTGAgcacAATCAg -453 3, glpD TTGATTacAATCgt -66 3, TTttTTaAtAaCAA -256 3, gltP TTGATgTAAAggAA -255 3, mdh gTGATTTtAAaCAA -351 3, moaA TTGATcTtgcTCAA -210 4, napFDABC TTGATaTAtATCAA -150 4, ndh TTGATTTAcATCAA -72 5, nirBDC-cysG aTGATaaAAATaAA 1 3, nqrABCDEF TTGtTcTAggTCAA -196 4, nrdDG TTtATaatggTCAA -397 3, pdhR-aceEF-lpdA aTGATTTtggTCAA -148 4, TTGATgaAAAaCAc -400 3, pepT TTGATggtgATCAc -53 3, TcGATgTccAaCAA -2 4, ppsA TTtATTTtcATCgA -466 3, sfcA TTGATaTAAAaCAt -180 4, yfiD TTGATTTAAgTCAA -127 4, TTGAccaccgaCAA -95 3, P. multocida acpP TTGATcaAAATCAc -115 4, adhE aTGATcTAtATCAt -152 3, arcA TTcATaaAtATCAA -28 3, atpB TTGtTcTAAATCAA -127 4, ccmABCDEFGH TTGATgTcccgCAA -394 3, cpxRA TTGAccTAgATaAA -172 4, TTctTTTtAATCAA -32 3, TTGAccTgtATCAA -305 4, cydAB TTGATTTAAAcCAA -131 4, dcuB TTGATTacAgaCAA -240 4, dmsABC TTGATTTAtATCAt -51 4, TTGATcTAtcTCAt -1 3, TaGATgTAAATCAA -108 4, eno TTGATagtcgTaAA -204 3, fdhD Сайт Геном Оперон Положение Вес Последовательность TTtAcgactATCAA -52 3, P. multocida fdxGHI TTGAgaTAgATCAA 9 4, fnr TTGtTgaAAATtAA -212 3, focA TTGAggTAgATCAc -133 3, frdABCD TTGATgaAgATCgt -118 3, fur TTGcTTaAtAgCAA -31 3, fur cTGATgTggATCAA -271 4, glpFK TTtATgTcAAgCAA -24 3, gntXY TTGATggAcATtAA -469 4, malQ-glgBXCAP TTGAcgaAgATCAc -97 3, TTGcgTTAcgTCAA -246 3, nagC TTGATcTAgcaCAA -120 4, napFDAGHBC TTGtgcTAgATCAA -89 4, narQ TTGAccTtctTCAA -332 3, nqrABCDEF TTGATggtcAcCAA 11 4, nrdAB TTGATcTggATaAA 48 4, TTGATcTAgATCAc -217 4, nrdDG TTGATcaAgcgCAA -142 3, nrfABCDEXFG TTGtTTTAccaCAA -475 4, pepT TTGtgaTAtgTCAA -74 3, aTGATcTtAATCAA -84 4, sodA TTGATccttcTCAA -246 3, torCAD TTtcTTatAATCAA -200 3, TTGATcTAAATCAA -138 5, yfiD TTGtTcTAggTCAA -96 4, TTGtTcTAAATCAA -126 4, A. actinomycetemcomitans ccmABCDEFGH TTGATgTgccaCAA -368 3, cpxRA TTtAcTTAcAaCAA -230 3, TTGATcTtgAgCAA -282 4, cydAB TTGATTTAtATCtA -237 4, TaGATcaccATCAA -420 3, dcuA TTGATTTAtcgCAA -85 4, dcuB TTaATTgtgAaCAA -261 3, dmsABC TTGATTTtgATCAt -118 4, TTGATTgcgATCcA -405 3, eno TgGATccAAATCAA -118 3, TTGATagttATaAA -348 4, fdhD TTtATaactATCAA -44 4. fdxGHI TTGAgcTAgATCAA -59 4, fnr TTGAcaaAgAaCAA -183 4, focA TTGAgTTAgATCAc -262 3, frdABCD TTGATgaAgATCgc -117 3, fur caGATTTAtATCAA 34 3, glpD TTtATTTAAAgCAA -136 4, gntXY aTaATcTAgATCAA -203 3, moaACDE TTttTacAAATCAA -95 3, ndh TTGATTTtgtgCAA -316 3, nqrABCDEF TTGATggtcAcCAA 14 4, nrdAB Сайт Геном Оперон Положение Вес Последовательность TTGATcaAAAaCAA -258 4, A. actinomycetemcomitans nrfABCDEXFG aTGATTccAATCAA -74 3, sodA TTGAcTgAAATCAA -110 4, torYZ TTGAcgTgcATCAA -117 4, yfiD gTGATcTtcATCAA -66 4, H. influenzae aspA TTGATTTAgATCAt -167 4, ccmABCDEFGH TTGtTTTAAATCAA -113 4, TTGATgTAccgCAA -381 4, cpxRA TTGATcTAAgTCAA -293 4, cydAB TTGATTTggcTCAA -87 4, dmsABC TTttTgTcAATCAA -145 4, dusB-fis TTctTcTAAAaCAA -267 3, eno TaGATaaAgATCAA -118 4, TTGAggaAAATaAA -14 4, TTGcgTTAgATCAA -49 4, fnr TTGtgaatAATCAA -320 4, focA TTGAggTAgATCAc -142 3, frdABCD TTtATTTttAgCAA -76 3, glgB TTGtgcTAAgTCAA -447 4, glpABC TTGATaaAcAagAA -267 3, gntXY TTGAcgaAgATCAc -86 3, malQ-glgBXCAP TTcAcTTtcATCAA -162 3, mdh aTGATTTAAATCAA -343 4, moaACDE TTGATTTttAagAA -221 3, cTGATTTtcATCAA -195 4, TTGATcTAtAaCAA -125 4, napFDAGHBC TTGATaTAtcgCAA -267 3, nqrABCDEF TTGtcaagAATCAA -136 3, nrdAB TTtATTTAAAaCAA -207 4, nrfABCDEXFG TTGATcaAgcTCAA -157 4, TTGtTTacAATCcA 65 3, pckA TTGtTaTAtATCAA -72 4, pepT TTGATcTAAATCgt -92 4, pgk TTGATTTAAAaCAA -149 4, sodA aTGATcTAAATCAA -95 4, TTcATTatAAaCAA -230 3, yfiD TTaATTTAgATCAA -143 4, TTGATTcctATCAA -135 4, H.

ducreyi ccmABCDEFGH TTGATgaAAATCAA -320 5, cydAB TTGATcaAAAcCgA -310 3, dcuB TTaATTTtAgTCAA -495 3, dusB-fis TTGATTTAccTCAA -100 4, focA TTGAggTAgATCAc -125 3, frdABCD TTcATcaAtATCAA -172 4, gntXY TTGAgcTttATaAA -228 3, hlyX TTttTTTcAATCAA -196 4, TTGcTaTAAATCAA -44 4, TTtATTTtAATCAt -210 3, moaACDE Сайт Геном Оперон Положение Вес Последовательность TTGATTcttATCAA -119 4, H. ducreyi napFDAGHBC TTGATTTAttTCAA -265 4, nqrABCDEF TTtATTTttcTCAA -332 3, nrfABCDEXFG TTGATTTAttTCAA -188 4, TTtATTTcAATaAA -184 3, TTtcTcTAcATCAA -262 3, pckA TcGATgaAgcTCAA 11 4, pflB TTGATTTAtATtAA -92 4, sodA aTGATTaAAATaAA -228 3, torYZ aTGATTTAggTCAA -144 4. V. vulnificus acpP-fabF TTGATaaAAAcCAA -445 4, adhE cTGATccAAgTCAA -176 3, TcGgTcaAAATCAA -468 3, aldB TTaATTaAcAaCAA -111 3, TTGATaTAAATCAA -327 5, arcA TTGATTTAggTCAA -232 4, atpIBEFHAGDC TTGtTaatgATCgA -7 3, TTGATTTAgATCAA -280 5, cydAB TTGATTcAAATCAA -230 4, TTGATgcAAATCgA -232 4, dcuC TTGATaTttATCAt -212 4, TTGcTTTAgATCAt -107 3, TTGATcTAAtTCAA -400 4, fadIJ TTGtTTTAtAcCAA -237 4, TTGATTTcAgaCAA -91 4, feoAB TTGAcgTAtATCAA -29 4, fnr TTtATTTAAtTCAA -491 3, glpABC TTGtTTTAtAaaAA -360 3, TTGATTgtAATCAA -100 4, mdh TTGATTgAgAaCtA -138 3, mtlADR TTGAccTAAAaCAA -93 4, nagB TTGATcTAAAaCAA -155 4, napFDABC TTGATcTAAcTCAA -128 4, napG TTGtTTTAgATCAA -158 4, narQP TTGATaaAtATCAA -225 4, ndh aTGAccTgAATCAA -405 3, nirBDC-cysG TTGcTTTAAAaCgA -209 3, TTGATTTAcATCAt -76 4, aTGATTacAATaAA -55 3, nqrABCDEF TTGATcTAAAgCAA -141 4, nrfA TTGcTTTAgATCAA -354 4, nrfBCDEXF aTGATTTAggTCAA -112 4, pdhR-aceEF-lpdA TTGgTcTcggTCAA 41 3, pepT aTGAcgTAAATCAA -393 4, pgk TTGATgTAtATCAA -88 5, sfcA TTGATTcAAAaCAA -154 4, torD TTGATTTAAcTCAA -164 4, yfiD TTGAccTAAATCAA -111 4, Сайт Геном Оперон Положение Вес Последовательность aTGATTTAAgTCAA -143 4, V. parahaemolyticus acpP cTGATccAAgTCAA -160 3, adhE TTaATTaAcAaCAA -107 3, aldB TTGATgTAAATCAA -322 5, arcA TTGATTTAggTCAA -180 4, atpIBEFHAGDC TTGATcTggATCAA -250 4, cydAB TTGATgTAtATCAA -200 5, TTGAgcgtcAaCAA -402 4, dcuC TTGtTTTAgATCAt -116 4, aTGATTgAtAaCAA -443 4, dmsABC TTGATagtggTCAA -273 4, TTGtTaTtAATtAA -53 3, TTGAaaTtAAaCAA -148 3, fadBA TTGATcTAttTCAA -389 4, fadL TTGATTTcAcaCAA -103 4, feoAB TTGATgTAtATCAA -29 5, fnr TTGtTTaAtATCAA -166 4, focA TTGAgTTttATCgA -127 4, focA aTGtTgaAggTCAA 26 3, gltA TTGATTgtAATCAA -100 4, mdh TTGATcgttATCAc -185 3, mtlADR TTGATcacgAaaAA -136 3, TcGtTTTctgTCAA 42 3, TTGtTTgtgATCAt -377 3, nagAC TTGAgTgAgATCAA -316 4, nagB TTGAccTAAAaCAA -92 4, TTGAcTTgAATCAA -109 4, napFDABC TTGATccAAAaCAA -152 4, napG TTGtTTTggATCAA -109 4, narQP TTGATaaAtATCAA -262 4, ndh TTGATTTAcATCAt -78 4, nirBDC-cysG aTGATTacAATaAA 1 3, nqrABCDEF TTGATcaAAATCAA -135 5, nrdDG TTGATcTAAAgCAA -138 4, nrfA TTGcTTTAgATCAA -350 4, nrfBCDEXF TTGAcTatcATCAA -33 4, oxyR TTGATTTgtAgCAA -408 4, pdhR-aceEF-lpdA TTGtTaaAAATtAA -316 3, aTGATTTAggTCAA -110 4, TTGtcTatcAaCAA -496 4, pepT aTGAcgTAAATCAA -406 4, pgk TTtAcgaAcgTCAA -498 3, sdhCDAB TTGAccTtcAaCAt -435 3, TTGATgTgcgTCAA -86 4, sfcA aTGtTcTccATCAA -397 4, talB TcGATTatgAgCAA -7 3, TTGATTcAAAaCAA -162 4, torD TTGATTTAAcTCAA -163 4, yfiD TTGAcTTAAATCAA -110 4, Сайт Геном Оперон Положение Вес Последовательность aTGATTTAtATCAA -48 4, V. cholerae acpP cTGATcTgAgTCAA -160 3, adhE TTGtTgTcAcTCAA -400 4, aldB TTGATgTAAATCAA -263 5, arcA TTGATTTAAATCAA -179 5, atpIBEFHAGDC TTGtTaTtgATCcA 46 3, TTGATTgtttTCAA -302 3, cydAB TTGATTTAgATCAt -236 4, TTGATTTAgATCAA -186 5, TTGtTcTAtgTCgA -6 3, TTGAccTAcATCAA -241 4, dcuB TTGcTTTAgATCAt -101 3, dcuC TTGATcTAAtTCAA -207 4, fadIJ TTGATcTtgATgAA -378 4, fadL TTGAcgTAcATCAA -29 4, fnr TTGcTaTAtAgCAA -311 3, fsfcA TTGATggAgcTCAA -118 4, fumC TTGAccTAAgaCAA -62 4, glgX TTttTgTtAAaCAA -372 3, glpABC aTGATcaAgATCAA -111 4, glpD TTGAcTTtgATtAA -77 3, gltA TTGATTaAgATCgg -71 3, TTGATagAAcgCAA -316 3, ldhA TTGATTgtAATCAg 27 4, mdh gTGATaaAtATCAA -350 3, mtlADR TTGAccTAAAaCAA -140 4, nagB TTGATccAAAaCAA -107 4, napFDABC TTGtTTTggATCAA -64 4, narQP TTGATaaAtATCAA -198 4, ndh aTGATTacAATaAA 49 3, nqrABCDEF aTGATTTAggTCAA -119 4, pdhR-aceEF-lpdA cTGATTTgtAaCAA -120 3, pepT TTGtTTatgAaaAA -7 3, TTGtccTtcATCgA -293 3, pflB aTGAcgTAAATCAA -376 4, pgk ccGATcTtAATCAA -332 3, sdhCDAB TTaATcaAAgTCAA -326 3, TTGATgcAAAgCAA -131 4, torD TTGAcacAAATCAA -164 4, yfiD TTGAccTAAATCAA -111 4, cTGATcTgAATCAA -363 4, V. fischeri adhE TTcATcTAcAaCAA 47 3, acGATaTtgATCAA -96 3, aspA TTGATTTAAATCAA -40 5, atpIBEFHAGDC TTGtTTaAtATCtA -72 3, ccmABCDEFGH TTGATTTAAATCtt -307 3, dmsABC TTGtTcTcgcTCAA -271 4, TTGATcaAAAaCAA -137 4, Сайт Геном Оперон Положение Вес Последовательность TTGtgaTcAAaCAA -141 3, V. fischeri fadBA TTGATcTAttTCAA -417 4, fadIJ TTGAcggAgATCAc -225 3, frdABCD TTtATccAtATCAA -164 3, TTGcTgTtcATCAt 63 3, glgX TTGcgTTAgATCAA -81 4, glpABC TTGATTatcATgAA -393 4, glpD TTGATTaAgATCAg -145 4, TTGAgcaAAATCAt -96 3, nagB TTGATcTAAAaCAA -114 4, napFDABC TTGtTTTAgATCAA -87 4, narQP TTGATccAcATCAt -71 4, nirBDC-cysG TTGATTTtgAaCAA -231 4, nqrABCDEF TTGATgTAAATCAA -140 5, nrfA TTGATTTAcATCAA -343 5, nrfBCDEXF TcGATcTAAcTCAA 33 4, pckA aTGATTcAAATCAA -145 4, pdhR-aceEF-lpdA aTGAcaTAAATCAA -403 4, pgk TTGATTgAtAaaAA -113 4, sfcA TTGATTcAAAaCAA -140 4, torD TTGATTTAggaCAA -152 4, yfiD TTGAcaTAtATCAA -99 4, Приложение 15.

Последовательности потенциальных сайтов связывания белка ArcA. Указано положение сайта относительно старта трансляции гена а также цепь ДНК, на которой он расположен: «» - прямая, «» - обратная. Позиции сайта, совпадающие с консенсусом, показаны прописными буквами, несовпадающие – строчными.

Сайт Геном Оперон Направление Положение Вес Последовательность TAACgaTaAaTTtAC -87 4, Y. pestis glpFK TAACATTTcagTAtC -331 4, dusB-fis TtgCATTTcaTTAAC -79 4, fadBA TAACAaaataaaAAC -377 4, gltP acACAaTTttTTAAC -48 4, dcuA aAACAaggAGTaAAC -17 4, GTaAACactATGaTA -8 4, TAtCATcaAGTTAAC -180 4, frdABCD TcACAaTaAaTTAAg -73 4, mdh GTTAAtTtAtTGTgt -94 4, GTgAAtacttTGTTA -32 4, pdhR-aceEF-lpdA TAAaAaTgAaTTAAt -343 4, dcuB GcTAAtTctAcGTTA -443 4, nqrABCDEF GTTAAaTAtATcTTt -420 4, ydiF GTgAAaaAAtTGaTt -68 4, GaTAAtTAttTtTTA -474 4, narP TAAaAaaTAaTTAtC -340 4, napFDABC TAACATagttTaAAt -28 4, fadL GTgAgtTtttTGTTA -191 4, aAACgTTTgGTTAAC -91 4, fadIJ cAACATTTtaTacAC -62 4, acpP-fabF TAACAaTTgGTTcAC -31 4, ndh GTTAAtcAAtaGTaA -395 4, adhE GTaAAtTAAtTGagA -118 4, dadAX GTTAAtTttcTGTcA -55 4, TAAaATaTtGTTAAt -22 4, fadD GTTAAaatAtTGTTA -24 5, TAAaAaTaAaTacAC -410 4, focA GTaAAtaAAtaGTTA -286 4, GTaAAaTAtAaGTTA -104 4, moaACDE GTTAAaaAgtTGTTA -474 4, cydAB GTTtAtTcttTGTcA -300 4, TgACAaagAaTaAAC -424 4, sdhCDAB TAACAacTttTTAAC -250 4, GTTAAaaAAATGTgg -179 4, gltA GTTAcCacAtTGTgA -12 4, arcA TAtCATTTAaTTAAC -84 5, glgBXCAP TcACATTTtaaaAAC -325 4, fdoH tTTAAaTAAtTGTTc -88 4, fdhD Сайт Геном Оперон Направление Положение Вес Последовательность TAACgaTaAaTTtAC -86 4, Y.


enterocolitica glpFK GTTAACatttTGaaA -187 4, glpABC TtgCAaTTcaTTAAC -79 4, fadBA TAACAaaataTccAC -68 4, TAACAaaatacaAAC -378 4, gltP TAACAaaTAtTTAct -248 4, GTaAACactATGaTA -8 4, dcuA cAtaATTTAGTTAAC -51 4, aspA TAACAaaTAcaaAAC -40 4, TAcCAaTcAGTTAgC -146 4, frdABCD TtACtaTTAaTTAAt -226 4, mdh GTgAAtacttTGTTA -116 4, deoCABD TtAtATTctaTTAAC -243 4, pdhR-aceEF-lpdA TAAtATTatGaTAAC -6 4, GgTAAtattATGaTA -8 4, TAACATTaAtTaAAa -24 4, dcuB GTgAgtTtttTGTTA -187 4, aAAtATTTgGTTAAC -89 4, fadL GTTtACcAAATGTaA -102 4, aAtCAaaaAGTTAAC -145 4, focA cAACATTTtaTacAC -62 4, acpP-fabF TAACAaTTgGTTcAC -31 4, ndh GTTAAagActgGTTA -366 4, GcTAACTAttTGaaA -211 4, GTaAAtTAAtTGTgA -119 4, dadAX GTTAAtTttcTGTcA -56 4, TAAaATaTtGTTAAa -78 4, fadD GTTAAaatAtTGTTA -80 5, TAACtTaTgGTTAAC -133 4, cydAB tTgAAtTAAtTGTcA -163 4, tTTAACTtAtgGTTA -135 4, GTTAACTAAcTGccA -124 4, aAAaAaTTttTTAAC -164 4, sfcA tTTAAtTAAtTcTTA -338 4, aTTgAaTAAcTGTTA -270 4, GTTAcaTAgtTGTTA -473 4, sdhCDAB GTTAACgAttTGTcg -462 4, GTTtAtTcttTGTcA -299 4, TgACAaagAaTaAAC -365 4, gltA cgACAaaTcGTTAAC -202 4, TAACAacTAtgTAAC -191 4, TcACAaTgtGgTAAC -180 4, fdoGHI GTTAcCacAtTGTgA -45 4, fdhD TAtCATTTAaTTAAC -86 5, sodA TAACtTgTgaTTAAC -339 4, mtlADR Сайт Геном Оперон Направление Положение Вес Последовательность TAACATaattTaAcC -379 3, Y. enterocolitica arcA tTaAACaAAtcGTTA -291 3, napFDABC aTTgAaTAAtTGTTc -156 3, atpIBEFHAGDC GTTAAaatctTGTTA -63 4, P. multocida sodA TAACAaaTcGccAAC -28 4, yfiD TgACAaTTtaTTAAa 36 4, GTTAAaTAAATGTTt -202 5, GTTtAtTtAtTGTTA -191 5, TtAaAaTattTTAAC -202 4, focA TAACAaTaAaTTgAt -191 4, TAAaATTTttTTAAa -80 4, GTTAAaatctTGTTA -251 4, tTTAAagtAATGTTA -229 4, GTTAAtTtgtTGaaA -218 4, GTTActTttATGTaA -55 4, pflB GTcAAtTAAATGaaA 9 4, GTTAttacAtTGTcA 41 4, dcuC TAACAgagcaTTAAC -167 4, gltA TAACATTTtaTTtAC -112 5, GTaAAtaAAATGTTA -220 5, sucABCD GTTAAtgctcTGTTA -165 4, TAACAgTaAaTaAtC -237 4, fnr aAACAaagAGgTAAC -19 4, fumC GTTAAaaAttTGTgA -140 4, aceEF-lpdA aTTAAtTcAtTGTTt -67 4, GTTAAtTgAATGTTA -227 5, ptsHI-crr GTTgctaAAATGTTA -334 4, cydAB GTTAAgTAAtTtTTg -179 4, dusB-fis TAACAaagtGTTAAC -231 5, aspA tTTAACaAAgTGTTA -233 4, TAttATTTAGTTAAa -258 4, nqrABCDEF TAtCAaaattTTAAC -227 4, GaTAACaAAATGTat -414 4, GTcAAaTttATGaTA -71 4, oxyR GTTAACaAcATtTTA -210 4, atpBEFHAGDC GaTAttgAAATGTTA -255 4, gntXY GTTAAaTtgATGaaA -353 4, talB tTTAAtcAAATGTgA -27 4, cpxRA TAACtaTattTTcAC -142 4, acpP GTTgctTtttTGTTA -299 3, fdxGHI TAACAaaaAagcAAC 42 3, fdhD tTTAttTtttTGTTA -342 3, torCAD TAACAaaaAaTaAAg -139 4, A. actinomycetemcomitans sodA GTTAAtaAAtTGTaA -95 5, GTTAAaagAATGaaA -66 4, dusB-fis Сайт Геном Оперон Направление Положение Вес Последовательность TAttATTTAGTTAAa -241 4, A. actinomycetemcomitans nqrABCDEF TAgCAaaaAtTTAAC -211 4, TtACAaaggGTTAAC -14 4, atpBEFHAGDC GTgAAtTAtAgGTaA -80 4, oxyR atACAaaTAtTTAAC -205 4, talB TAACATTaAtTTAAC -194 5, aTTAAtTAttTGaTA -362 4, dcuC GTTAAaaAttTGTaA -149 4, aceEF-lpdA TcACATTgAtTTAgC -318 4, fnr GTTAAtTcAcTtTTt -306 4, torYZ TAtCAaaaAaTTAAC -119 4, fdhD GTTAAaTAtcTGTTA -246 5, GTTAtacAttTGTTA -235 4, TAACAaaTgtaTAAC -158 4, fdxGHI TAACAgaTAtTTAAC -147 5, GTTAAtTtttTGaTA -274 4, TAtCAgTTAGTaAAa -126 4, sucABCD GTTAAaTtttTGTaA -60 4, GTagAtaAttTGTTA -37 4, pflB gAAaATaTAaTTAAC -124 4, focA GTTAAaaAAtTaTaA -28 4, TAAaATTgctTTAAt -32 3, frdABCD GgTAACTAttTGgaA -354 3, cpxRA GTTAgaTcAATtTaA -33 3, aspA GcTAACTcttTGaTA -215 4, ptsHI-crr TAACgaTTttTTAAC -124 4, H. influenzae fdhD TAAaAaTaAtTTAAC -49 4, TtACATTTAacTAAt -27 4, cTTAAtgAAtTGTaA -484 4, aTTAgtTAAATGTaA -258 4, fdxGHI GTTAAaTtAtTtTTA -236 4, GTTAAaaAAtcGTTA -161 4, TAAaAaTTAaTTAAa -124 4, yfiD GTTAAaTtAATGTTA -196 5, GTTAAaTtAtTGaTA -185 4, GTTAAtacAtTtTTA -236 4, ldhA TAtCAaTTAtTgAAC -423 4, nqrABCDEF GTTAtaaAAATGTaA -287 4, TAtttaTTAaTTAAC -21 4, pflB TAACcaaattTTAAC -468 4, focA aTTAACcAAATtTTA -470 4, GTgAttTAAtTGaTA -470 4, fur GTgAAaaAAtgGTTA -299 4, napFDAGHBC GcgAAtTAttTGaTA -253 4, tTgAAtTAAATGaTA -52 4, fadD Сайт Геном Оперон Направление Положение Вес Последовательность GaTAACaAtATcTTA -352 4, H. influenzae gntXY aTTAttTAttTGTTA -155 4, pgk TgACgaTaAaTTAAC -26 4, aspA aTTAACTttcTGTaA -496 4, torYZ TAAtATTgtGTacAC -435 4, glpFK TAtCATTacaTTAAt -54 4, ndh TtACATTaAtgTAAC -49 4, TAACATTTttTTAta -73 4, pckA cTTAAaaAAATGTTt -104 4, GTTAttaAttTGTaA -91 4, frdABCD TAAaATTTgaTcAAC -192 4, cpxRA TgAtATTgAaTTAAC 27 4, GTTAAaacAcTtTTA -460 4, aTTAAagAAATGTTA -164 4, nrfEXFG TAtCAaTTAGTTAAa -432 4, sucCD GTTAAaTgttTGTgA -88 4, aceEF-lpdA GTTAgCgtAATGTcA -455 4, moeAB TttCATTagtTTAAC -171 4, ptsHI-crr GcTAAtTcgtTGTaA -303 3, oxyR tTTtACTAttTtTTA -212 3, cydAB aAACATTTAaTgAtC -104 3, sodA GTTAAtaccATtTTA -498 4, H. ducreyi dcuA TAgCAgTTAaTTtAC -246 4, frdABCD TAAtATaaAaTTAAa -145 4, napFDAGHBC aTTAAtTcAATcTTA -464 4, aTTAtCTAAATGTaA -289 4, GgTtAggAAATGTTA -202 4, tTTAAtTAtcTGTTt -51 4, ptsHI-crr TcACATTaAtTTAAa -76 4, mdh aAAaAgTgAaTTAAC -122 4, arcA cAACAaTaAtTcAAC -63 4, TAAaAaTgAtTacAC -496 4, sodA GgTAAaTAAAaGTTA -257 4, nrfABCD tTTAAaTcAAcGTTA -325 4, nqrABCDEF TAAaAaTTAtTTAAC -419 4, dusB-fis GTaAACTcAccGTTA -449 4, oxyR GTgtAtgAAATGTcA -181 4, GcTAAtTtttTGTTA -274 4, ccmABCDEFGH TgACcTTgAtTTAAC 21 4, pgk GTaAtCatAtTGTTA -185 4, focA TAAaAaTTAtTaAAC -33 4, yfiD GTTtAaTtAcTGTTA 11 4, fadL TAtCATTTttTTcAg -393 4, fdhD tTTAAtTtAtTtTTA -347 4, glpFK Сайт Геном Оперон Направление Положение Вес Последовательность aTTAACTAttTGaaA -154 4, H. ducreyi glpABC GgTgAtTttATGTTA -10 4, pckA GTTAttattcTGTTA -115 4, sucABCD TgACcTagAaTTAAC 25 4, cpxRA tTTAAaTAAATGTTc -144 4, TAtCATTactaTAAC -37 4, aceEF-lpdA GTTAAaatttTGaaA -119 4, moeAB TAACATTcAaTTAAC -216 5, cydAB TAACATTTtaTTcAg -205 4, tTTAAaaAAtgGaTA -438 3, gntXY GTaAAaaAAATGcaA -339 3, aspA TAcCATacctTTAAC -276 3, ndh GaTAACaAtcTtTTA -324 3, moaACDE TAAaAgaTtGTTAtC -115 3, torYZ GaTAAtcAAtTtTTA -486 3, fnr TAACAaaattTaAAC -133 4, V. vulnificus fadD GTTAACaAAATtTaA -135 4, GTTcACTAtAaGTTA -322 4, feoAB GTaAACaAAAcGTTA -191 4, TAACAagTttTTtAC -117 4, sdhCDAB GTTAAaaAtcTGTTc -264 4, GTTAACTcctTaTaA -179 4, GTTAAtTAAATGTTA -73 5, TAACATTTAaTTAAC -337 5, gltA TtAtAaggAGTTAAC -231 4, gAACAgaTttTTAAC -146 4, GTaAAaaActTGTTA -293 4, GTTAttaAAtTGTaA -171 4, fur TAcCAagTtGTaAAC -54 4, dadAX GTTAcCaAgtTGTaA -56 4, GaTtAaTAAtTGTTA -353 4, arcA GTTAAtTgAtTGTaA -105 4, mdh aTTAAtaAAtTcTTA -50 4, pckA GTTtAaaAAATGTat -158 4, fadBA cAACATccAaTTAAC -248 4, frdABCD GTTtACTAttTGTaA -197 4, pdhR-aceEF-lpdA GTTAAtTAAATGTaA -289 5, glpFK TAACAcTgttTcAAC -422 4, nqrABCDEF tTTAAaTAAATGTgA -129 4, ccmABCDEFGH GTTAACaAAtTcTcA -108 4, TgtCATcTAGTTAAC -353 4, fadIJ TAtCgTTTtaTgAAC -134 4, pflB TAACAaTTAacTAAC -138 5, cydAB GTTAACaAAcTGTct -304 4, GTTAACccAATGTTt -180 4, ldhA Сайт Геном Оперон Направление Положение Вес Последовательность TAACATTTAGaaAAg -389 4, V.

vulnificus fnr tTTAACTcAATGaTt -276 4, aAtCATTgAGTTAAa -220 4, nrfBCDEXF cTTttCTAAATGTTA -107 4, TAACtTTTAaTTtAC -261 4, nrfA TAtCAaTgAaTTAgC -241 4, tTTtAaTAttTGTTA -46 4, atACAaaTAaTaAAC -109 4, adhE tTTAAtTcAATGTcA -487 4, ppsA TtACATTaAaTTAAC -123 5, glpABC TtACAaaaAGTaAAC -267 4, fadL TttCcgTgAGTTAAC -130 4, tTTAACcAcATGTTA -405 4, GTTActTcAtTGTcA 54 4, dcuB GTaAAgatttTGTTA -340 4, dcuC TAACAaTgAtTTgAg -451 4, talB aTTAAtaAAcTGTcA -246 4, TtACATTTAaTTAAC -117 5, narQP GTgAACTcAATGagA -266 4, aldB TAtCAaaTAGTgAAa -21 3, fnr TgACAgTTtaTTAAt -61 4, napFDABC TAACAaTagGTatAC -49 4, V. parahaemolyticus fadBA GTTtAaaAAATGTat -162 4, GTTAAtTgAtTGTaA -105 4, mdh TAtCAaTTAaTTgAt -195 4, mtlADR GTTAACaAtATaaaA -267 4, arcA TtttATTgAtTTAAC -168 4, yfiD aTTAAaTAttTtTTA -221 4, cTTAAaTcAATaTTA -106 4, GTTAAtaAAAgGTaA -58 4, dadAX TAACATTTgaTTAAC -336 5, gltA aAACAcTTtGTTAAC -290 4, gAACAgaTttTTAAC -144 4, GTaAACacttTGTTA -292 4, TAACAaagtGTTtAC -118 4, sdhCDAB GTTAAaaAtcTGTTc -266 4, GTTAACaAAgTGTTt -120 4, GTTAAtcAAATGTTA -74 5, TAtCAgaaAtTaAAC 6 4, feoAB GTTAAgTtttTGTTt -216 4, TAACAaaattTaAAC -120 4, fadD GTTAACaAAATtTaA -122 4, TAACAaTTAacTAAC -108 5, cydAB GTTAACTcgATGTTt -326 4, TtACATTTAaTTAAC -113 5, aldB Сайт Геном Оперон Направление Положение Вес Последовательность tTTtAaTAttTGTTA -31 4, V. parahaemolyticus adhE TAACAaaTtGaTtAC -53 4, fadIJ TgACAgTaAGTTAAC -115 4, ccmABCDEFGH aAAaAaTgtGTTAAC -376 4, nqrABCDEF TAAtATTaAGTaAAC -39 4, cpxRA GcTAAtTtAtTcTTA -451 4, fumC TAtaATTgcaTTAAC -96 4, atpIBEFHAGDC GTaAACatAATaTTA -161 4, ppsA aAACATacAaTTAAC -125 4, fadL TAACATTacGTTtAC -114 4, TAACAaaTAGTgAtC -327 4, nrdDG aTTAAtaAAcTGTcA -196 4, narQP TgACAgTTtaTTAAt -66 4, napFDABC aTTAAaacAtTcTTA -49 3, pckA TAtCAaaTAGTgAAa -21 3, fnr GTTAACaAAtTcaTg -116 3, glpFK TcACAcTgcaTaAAC -308 3, gltP TAcaATTTAGTTAAa -150 3, TAAaATTgtcTTcAC -125 4, V. cholerae mdh GTTAAtTgAtTGTaA 22 4, GTTAAtgAAAaGTaA -51 4, dadAX TtACAaaaAaTaAAC -31 4, ptsHI-crr TAtCATTTAaaTAAa -424 4, fumC gAtCcTTTtGTTAAC -184 4, aldB TAACAaTTAacTAAC -94 5, cydAB TtttAaTTttTTAAC -132 4, pflB TAACAaaattTaAAC -136 4, fadD GTTAACaAAATtTaA -138 4, TAACATTTttTTAtt -28 4, adhE GTTtAaTttATGTTt -217 4, GTTAcCTctATGaaA -8 4, feoAB GTTAAaaAtcTGTTc -263 4, sdhCDAB GTTgAaTAAATGTTA -72 5, TAACATTTAtTcAAC -332 5, gltA gAACAgaTttTTAAC -141 4, GTTAAaTtAtTGTaA -287 4, fur gAgCAaaTtaTTAAC -401 4, nqrABCDEF cTTAACTAttTtTTA -222 4, yfiD tTTActTtAtTGTTA -96 4, arcA TAACAaTTAcaTAAa -55 4, pckA GTTtAaaAAATGTat -125 4, fadBA GcTAAaacttTGTTA -156 4, gltP TAACAaaacGTgcAC -383 4, narQP gAtCAaTaAaTTAAC -56 4, Сайт Геном Оперон Направление Положение Вес Последовательность GTTAAtTtAtTGaTc -116 4, V. cholerae napFDABC GaTAAaTAttTGTgA -85 4, glgX TAACAgaTtaacAAC -109 3, torD aaTAACTAAATGTgA -433 3, pdhR-aceEF-lpdA aAACAaaTtGTTAAa -118 4, V. fischeri fadBA TAAtAaTgAaTacAC -45 4, GTaAACaAAtTGTTA -120 5, TAACATaaAaTaAAt -312 4, nqrABCDEF TAACATTTAtgcAAC -334 4, gltA GTTgcaTAAATGTTA -68 4, sdhCDAB GTTggtTAAtTGaTA -277 4, sucABCD TgACATTTAaTTAAC -151 5, cydAB aAACAaTaAaTacAC -159 4, gltP TAcCAaaTtGTaAAC -380 4, ldhA aAtCAaTTAGTTAAa -34 4, dcuB TAAataaaAGTTAAC -111 4, ppsA GTTAAtTcttTtTTA -197 4, TAACAaTggtTTAAt -441 4, pflB GTTAACgtAATaTcA -472 4, moeAB GTctAtTAgATGTTA -73 4, GTTcAaTcAtTaTTA -39 4, TAACAaTTAtTcAtC -181 4, dcuC GTTAAtTgttTtTTA -262 4, fadIJ GTTtgtTAAtTGTgA -186 4, napFDABC TcACAaTTAacaAAC -16 4, narQP cTgAAtTAAtTGaaA -128 4, yfiD TtACtTTTtaTTAAC -114 4, arcA GTTAACTAAATGTat -176 4, pdhR-aceEF-lpdA TAAaAaagAaTgAAC -499 4, frdABCD TAcCtaTTttTTAAC -351 4, GTTAcCTAttTtTTA -353 4, GTTgAagAAATcTTA -194 4, cpxRA TAAaAgagtGTaAAC -292 4, aspA cAtCATTTAGTTcAC -463 4, glpFK TtACATaTgaTTAtC -271 4, glpD TAtCAgTaAtTTAAt -191 4, pepT GTaAAaTtAtTGTTA -194 4, glgB GTTAACTtAATcTcA -69 4, GTaAAtTgtcTGTTA -153 4, glgC TAACAaaTAaaTAAC -413 4, focA GTcAAtTtAcTGaaA -102 3, feoAB TtttAaTTAaTTAgC -449 3, nrfBCDEXF GTaAAtTAtATacTA -393 3, TAgtATaTAaTTtAC -91 3, nrfA GcTAAtTAAtTaaaA -35 3, Сайт Геном Оперон Направление Положение Вес Последовательность GTTgcaaAAcTGTTA -320 3, V. fischeri pckA TttCATTTAGTTAAC -342 5, fadL TAACgaTTttTTAgC -143 4, GTTAAagctcTaTTA -209 4, tTTAACgAttTtTTA -145 4, Приложение 16.

Последовательности потенциальных сайтов связывания белка NarP. Указано положение сайта относительно старта трансляции. Позиции сайта, совпадающие с консенсусом, показаны прописными буквами, несовпадающие – строчными.

Сайт Геном Оперон Положение Вес Последовательность cACCTtTatAaAGGTg -469 3, Y. pestis glpFK TAaCctTaAAGgGaTA -482 3, fadBA TAaaaCaTAAttGGTA -346 3, gltP ctCCTCgaAAGAGGTA -178 3, dmsABC TAaCTCTaAAGAGtaA -184 4, napFDABC TAgtatTTAAtgGGTA -392 3, ptsHI-crr TACCTaTTttGcaGTA -319 3, TACCTCTatAagGGTA -113 4, ccmABCDEFGH TAaCgtTTAAGAGtaA -23 3, sfcA TACtTtTattGAGGcA -366 3, pflB TtaacaTTAAaAGGTA 47 3, aAaCaCaTtAaAGGTA -26 3, nrdAB TAaCatTTAAatGtTA -372 4, cydAB TACCaCcTtAGAGGTA -99 4, nirBDC-cysG TACCaCaTtgtgatTA -10 3, fdhD TAaCcCTatAagaGag -24 3, focA TAatcacaAtGtGGTA -171 3, fdoGHI TtaCTCTTtAGAGtTA -338 4, Y. enterocolitica narP TAaCTCTaAAGAGtaA -182 4, napFDABC TACCTCTatAagGGTA -113 4, ccmABCDEFGH TACtaCgTAAGgatTA -79 3, TAaCctTatAGAGtTA -180 4, torYZ TtCacaTTAAaAGGTA -23 3, pflB TAaCcCTTAAGAGagA -21 3, focA TtCtTCTTtgGtGGaA 66 3, fadD TAaCgtTTAAGAGtgA -22 3, sfcA TACCaCcTtAGAGGTA -101 4, nirBDC-cysG TAatcacaAtGtGGTA -183 3, fdoGHI TACCaCaTtgtgatTA -43 3, fdhD TcCCTtTatAGtGGgA 10 3, atpIBEFHAGDC cACCTCTaAAGAGGTA -99 4, P. multocida ccmABCDEFGH TAaCTCTaAAtAGGTA -289 4, nrfABCDEXFG TACtTaTTtAGAGGTA -206 4, TAatTaaTAgaAGGTA -17 3, pflB TAaCTtTTttGAGGTA -141 4, frdABCD TAataaTaAgGAGtgA -290 3, gltA TcaCTCcTtAttatTA -43 3, sucABCD TtCCTtaTtAatGGTA -234 3, fdxGHI TACCatTaAtaAGGaA -24 3, fdhD TAaCTaTTAAtcatTA -38 3, malQ TAaCcCaTAAGgaGTA -21 4, mdh cACtTCTTAAttGtaA -23 3, fnr TACtTaTTtAtAaaTA -149 3, nrdAB Сайт Геном Оперон Положение Вес Последовательность TAaCcCgcAAGtGtTA -64 3, P. multocida fumC TAaCcCTTtAtAaGTA -376 4, nqrABCDEFBCDEF TACtcaTTAAGAGtaA -351 4, TACCTaTTtAttGcTA -105 4, dcuB TACtaCTTttcAGGTA -77 3, adhE TAaCagTTtttAGGTA -79 3, pckA TAaCTCTatgagGtaA -18 3, aAaCaCTTAgGAGGaA -238 3, talB TACCTCTTtttgGtTg 19 3, dmsABC TAaCTCTTAAaAGaTA -268 4, torCAD TAgtTagaAAGgGGTA -68 3, pgk TtCaTtTaAAGAGGaA -22 3, eno TtCtTaTaAAaAatTA -105 3, dcuA TAaCatTTtAGAGGTA -22 4, TgatgaTaAAGAGGTA -251 3, napFDAGHBC TACCTCTTtAtAGtTA -403 4, A.

actinomycetemcomitans nrfABCDEXFG TtCCcCTTtAatGaTA -365 3, TACtaaTaAAtAGGTA -343 4, TACCgtgaAAGAGtTA -99 3, ccmABCDEFGH cAatatTTAAGAataA -311 3, frdABCD TAaCTtTTttGAGtTA -270 4, TAaCagTctAaAGtTA -182 3, TAaaTtaaAAGtatTA 7 3, narP TAaCTtaTAtGAGGaA -20 3, eno TACCTCTTtgGtatTA -351 4, nqrABCDEFBCDEF gACCTCTTtAGcGtTA -495 3, dmsABC TcaCcaTaAAtgGtTA -44 3, TACCaCTTtttgaGTg -477 3, atpBEFHAGDC TtatTCTaAgGAGGcA -19 3, dcuA TAatcaTTAAGAGGTA -20 4, fumC TACtaCaTgAGgaGaA -18 3, mdh TACCaaTTtgtgatTA -257 3, aceEF-lpdA TAatgaaTtAGtGGTA -78 3, fnr TAatTaTTAtGAGGTA -296 4, moaACDE TAaCTCgTtgtAGtTA -63 3, torYZ TtCCTtTTAgttatTA -43 3, TAagTaaTAAtAGtTA -182 3, fdhD TAaCTaTTAttActTA -212 3, fdxGHI TtCtTCTaAttgGGTA -392 3, dcuB TACtaCTTAAGAaGTA -56 4, TAatTCTaAgtAGtTA -50 4, adhE TcatTaTaAtaAGGTA -107 3, cydAB TAatctaaAAGAGGaA -18 3, pflB TACtcaTTtgtAGtgA -153 3, napFDAGHBC TAaCTtTTtAGAGGaA -23 4, ptsHI-crr TACCTaTTttGgGtTg -87 3, H. influenzae napFDAGHBC TACCTCaaAAtAtGaA 52 3, fadD TAgCaCgaAgtAGGTA -71 3, pgk Сайт Геном Оперон Положение Вес Последовательность TAaCTaTaAgtAGtTA -47 4, H. influenzae torYZ gAatTCTTAAaAGGaA -254 3, glpFK cACtTCTaAgGAGtgA -20 3, aACCaCTaAAGgaGaA -18 3, narP TACCTaTTtgttGcTA -76 3, dcuA TAaCTCaaAAaAataA -135 3, ndH TcaCTaaaAAGAGGTA -125 3, pckA TAgCTtTTttGAGGTA -150 4, frdABCD TACCctTTtAGgGGat -47 3, TACtTtTaAAaAGGTt -283 3, arcA cACtTtTTtAttGtTA -82 3, TACgcCaaAAtAaGTA -27 3, TAaCTtaattGAGGaA -22 3, eno TcCCcaTTAAatGGTA -437 3, dmsABC TAgtTaaTAAtAGtTA -240 3, TACCTaTTAAtgatTA -104 4, TAaCTCgTtttAGtTA -46 3, TACCTCTTtttgaGTA -188 4, nrfABCD TAaCctTTAAaAataA -133 3, cydAB TAaCTCTTtAGAaGTA -179 4, sodA TACtTCTaAAGAGtTA -85 4, ccmABCDEFGH TACCctTTtAatGcTA -71 3, talB TtCCatTTtgGtatTA -384 3, mdh TAaCaCaTAAGgaGTA -20 4, TcCCTaacAAGAGtTA -29 3, malQ TAaCTCggAAGtGtTA -62 3, fumC aAaCTaaTtAGtGGTA -71 3, fnr TcataaTaAAGAGGTA -18 3, sucAB TACCTCaTAAtAatcA -323 3, moaACDE TAaaaaTTtAtgGtTA -305 3, TAtCaCTaAtGAGcTA -269 3, TACCTaaatgGAGtgA -81 3, H. ducreyi napFDAGHBC TACCTCTcttGAGGTA -97 4, dcuB TtCCatTTtgGtatTA -373 3, mdh TAaCcaTTtAtgatTA -26 3, TACtaCTTttGAGtTA -308 4, nqrABCDEFBCDEF TtaCTCgaAAtAGtTA -66 3, aspA TACtataaAAaAGGTA -117 3, ccmABCDEFGH TACCTCTaAAGAaGTA -86 4, TcgCcCaaAAtAGGTA -72 3, pgk TACaTtTTAAGActTA -33 3, TAaCaCTaAAaAGtgA -97 3, ndh TACtTtTTttGAttTA -47 3, TcaCaCTTtAttatTA -204 3, pflB TAaCatTTAAGAGGac -21 3, TAaCTCTTtctgGtTA 48 3, yfiD gACCTCTTAtttGtTA -127 3, sucABCD TAaaaCTatAaAatTA -239 3, moaACDE Сайт Геном Оперон Положение Вес Последовательность TAatTtTatAGtttTA -201 3, H. ducreyi torYZ TAaCaCTTggtgaGTA -276 3, aceEF-lpdA TtCtTaTTtAGgGtTA -152 4, cydAB TACCTCTattatataA -111 3, TAttTCaatAaAaGTA -182 3, nrfABCD TAaCTCaatAaAataA -158 3, V. vulnificus yfiD TACCcCTTtAGAGtTA -224 4, aspA TACtaCTTttGgGGag -85 3, frdABCD TAtCTaTaAtGtaGTA -369 3, deoCABD TcaCTCTatAGAGGTA -147 4, ccmABCDEFGH TtCtaCTaAAaAGGTA -23 4, pflB TACCTCTaAAtAGGTA -389 4, cydAB TtaCcCTTttGgGGTg -102 3, napGH TACCctTTtgGgGtgA -101 3, TACCcCTaAAGgGGTA -304 4, nrfBCDEXFG TACtaCTaAAGAGtag -202 3, ctaCTCTTtAGtaGTA -295 3, nrfA TACCcCTTtAGgGGTA -193 4, TACtcacaAgGtGGTA -255 3, moaABCDE cACCaCTTtgGgGGTA -207 4, adhE TACCcCTTtAGgGtag -105 4, nirBDC-cysG TAaCcCTTAgGAaGTA -17 4, TACCcCTTAgGgGGTA -188 4, narQP TACCagTaAAatGGTA -191 3, glgB TACCTtaaAAaAaGTg -420 3, gltP TACtTtTTtAttttTA -83 3, TACtctTaAgttGtTg -242 3, feoAB TACCcCcTAAGgGGTA -281 4, napFDABC TAatTtTaAgtAatTA -223 3, V. parahaemolyticus pckA TACCTCaatgGAaGTc -6 3, dadAX TACtctTaAAtAataA -50 3, feoAB TtCtaCTaAAaAGGTA -23 4, pflB TtaCaCTTAgGgGaTA -67 3, torD TAataCTaAttAGGTA -359 4, cydAB TACCcCTaAAGtGGTA -300 4, nrfBCDEXFG TACCTCTTAgGAataA -196 4, TtatTCcTAAGAGGTA -294 4, nrfA TACCaCTTtAGgGGTA -190 4, TACtcacTAAGcGGTA -217 3, moaABCDE cACtaCTTtgGtGGTA -191 3, adhE TAgCcacTtAtgGtTA -145 3, ccmABCDEFGH TACCTCTTAgGgatTA -326 4, glpFK TAtCTaTaAtGtaGTA -372 3, deoCABD cAaCTtaaAAttGGTA -52 3, pdhR-aceEF-lpdA TACtaCTTttGgGGag -87 3, frdABCD TACCcacaAAGgGtTA -226 4, aspA aAaaaCTaAAGAGGTA -22 3, dcuA TACtTtTTggGAGGgA -18 3, ldhA Сайт Геном Оперон Положение Вес Последовательность TACCcCTTtAGgGtag -107 4, V. parahaemolyticus nirBDC-cysG TAaCcCTTAgGAaGTA -17 4, TACCTCTTAgGAGGTA -139 4, narQP TACCTCcTAAGAGGTA -124 4, napFDABC TACCTCTTAtGAGGTA -82 4, napGH cACCaCgTAAGtGGTc -27 3, yfiD TACCTgcatAaAaGTA -147 3, V. cholerae dadAX TACaaCTTAAcAatTA -101 3, cydAB TACCcCaaAAGgGGTA -45 4, torYZ TACCaCTTgttAGGTA -191 4, adhE TAaCTacaAAGgGtTA -143 4, ccmABCDEFGH TAatcCTatAGActTA -322 3, focA TACCTCTatgaAatTg -6 3, TtaCaaTTttGtaGTA -257 3, yfiD TAaCTaTTttttatTA -220 3, cAaCTtaaAAttGGTA -61 3, pdhR-aceEF-lpdA TACCaCTTAAtgGGTg -134 4, frdABCD TAaaTCaattGtGGTA -173 3, atpIBEFHAGDC TtCCcacTAAtgGGTA -53 3, ldhA TACCTCTTAgGAGGTA -94 4, narQP TAgCcCTaAAGAGGTg -20 4, cACCTCTTtAGgGcTA -153 4, napFDABC TACCTCcTAAGAGGTA -79 4, TgCCaaTaAAGAGGTg -50 3, V. fischeri gntXY TgCCTCaaAAGAaGTA -241 3, deoCABD TgCtaCTTAtGgGGTA -251 3, nqrABCDEFBCDEF TACCaCcTtAGAGcTA -114 4, nirBDC-cysG TACCcCTTtcGAGtag -100 3, TACaatTTttGgGGTA -209 3, fur ctaCcCgTAAGgGGTA -408 3, adhE TAagTCgaAAGtGGTA -394 3, TtCtataTtAGAGtTA -170 3, cydAB TAaCaCTTtgtgGtTA -118 4, ctCtcCTaAAttGtTA -203 3, gltP TAataaaTAAGAGcTA -57 3, aACCTCTTAAGcatTA -241 3, ldhA TACtaaTTAAGAGGTA -383 4, nrfBCDEXFG cACCatTaAAGAGGTA -309 4, TACCTCTTAAGtGtTA -293 4, TAtCaCaaAAGgaGTA -205 3, TACtcCTTttGtGaTA -280 3, nrfA TAaCaCTTAAGAGGTA -192 4, TACCTCTTtAatGGTg -176 4, TACCTCTTAAttaGTA -102 4, TACCaCTTtActttTA -431 3, sfcA TAaaTtTTtAtgGtTA -221 3, ctaCTCaatAaAGGTA 62 3, TAataCTTAtGgGGTA -270 4, pflB Сайт Геном Оперон Положение Вес Последовательность TtCtaCTaAAaAGGTA -25 4, V. fischeri pflB TACCTacaAAGtGGTA -191 4, ccmABCDEFGH TACaaaTTAcaAGGTA -141 3, TAaCaaTTttGAacTA -179 3, ptsHI-crr TAaCcaTTAtGgGGTA -86 4, napFDABC TACCcCaTAAtgGtTA -117 4, narQP TAaCTCaTtttgatTA -262 3, dcuB TACCTacaAttgGtTA -287 3, yfiD TACCcCcaAAtAGtTA -399 4, pdhR-aceEF-lpdA TgCCcCaTtAGtGGTA -195 3, frdABCD TACCaCTaAAGAGGTg -141 4, aspA TtaCTaTatAtAGcTA -67 3, dcuA TAatTaTTtAatatTA -34 3, TAatatTaAtGAGtTA -461 3, nagB TACCaCTTtAtgGtTA -126 4, pckA TAaCcCcaAAGtGGTA -65 4, torYZ TAaaTaTTAAGAatgA -90 3, glpFK TACaTCaaAAGtGGTA -32 4, glpABC TtCaTCTTAAaAGcTA -163 3, pepT TtaCTCTTtAGgGGTA -492 4, torCA TACtctTTAgGgGtaA -491 3, TAaCgaTTtAGAatTA -34 3, TACaTaTTttaAaGTA -232 3, glgC

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